Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Irf1P15314 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Irf1P15314 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf1P15314 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf1P15314 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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