Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms