Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FosbP13346 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FosbP13346 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FosbP13346 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FosbP13346 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FosbP13346 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FosbP13346 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FosbP13346 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FosbP13346 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FosbP13346 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FosbP13346 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FosbP13346 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FosbP13346 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FosbP13346 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FosbP13346 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FosbP13346 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FosbP13346 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FosbP13346 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FosbP13346 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FosbP13346 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FosbP13346 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FosbP13346 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FosbP13346 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FosbP13346 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FosbP13346 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FosbP13346 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FosbP13346 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FosbP13346 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FosbP13346 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FosbP13346 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FosbP13346 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FosbP13346 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FosbP13346 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FosbP13346 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FosbP13346 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FosbP13346 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FosbP13346 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FosbP13346 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FosbP13346 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FosbP13346 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FosbP13346 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FosbP13346 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FosbP13346 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FosbP13346 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FosbP13346 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FosbP13346 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FosbP13346 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FosbP13346 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FosbP13346 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FosbP13346 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FosbP13346 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FosbP13346 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FosbP13346 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FosbP13346 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FosbP13346 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FosbP13346 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FosbP13346 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FosbP13346 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FosbP13346 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FosbP13346 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
FosbP13346 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FosbP13346 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FosbP13346 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FosbP13346 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FosbP13346 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FosbP13346 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FosbP13346 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FosbP13346 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FosbP13346 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FosbP13346 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FosbP13346 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FosbP13346 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FosbP13346 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FosbP13346 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FosbP13346 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FosbP13346 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FosbP13346 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FosbP13346 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FosbP13346 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FosbP13346 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FosbP13346 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FosbP13346 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FosbP13346 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FosbP13346 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FosbP13346 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FosbP13346 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FosbP13346 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FosbP13346 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FosbP13346 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FosbP13346 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FosbP13346 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FosbP13346 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FosbP13346 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FosbP13346 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FosbP13346 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FosbP13346 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FosbP13346 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FosbP13346 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FosbP13346 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FosbP13346 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms