Protein–RNA interactions for Protein: P12961

Scg5, Neuroendocrine protein 7B2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg5P12961 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg5P12961 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scg5P12961 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Scg5P12961 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg5P12961 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg5P12961 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms