Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtrP07309 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TtrP07309 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TtrP07309 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtrP07309 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TtrP07309 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms