Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01652 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01652 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01652 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01652 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01652 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01652 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01652 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01652 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01652 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01652 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01652 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01652 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01652 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01652 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01652 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01652 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01652 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01652 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01652 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01652 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01652 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01652 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01652 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01652 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01652 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01652 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01652 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01652 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01652 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01652 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01652 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01652 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01652 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01652 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01652 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01652 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01652 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01652 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01652 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01652 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01652 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01652 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01652 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01652 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01652 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01652 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01652 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01652 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01652 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01652 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01652 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01652 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01652 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01652 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01652 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01652 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01652 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01652 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01652 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01652 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01652 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01652 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01652 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01652 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01652 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01652 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01652 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01652 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01652 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01652 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01652 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01652 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01652 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01652 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01652 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01652 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01652 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01652 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01652 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01652 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01652 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01652 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01652 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01652 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01652 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01652 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01652 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01652 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01652 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01652 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01652 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01652 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01652 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01652 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01652 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01652 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01652 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01652 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01652 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms