Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms