Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ccl20O89093 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ccl20O89093 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ccl20O89093 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ccl20O89093 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl20O89093 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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