Protein–RNA interactions for Protein: O88892

Serf1, Small EDRK-rich factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serf1O88892 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Serf1O88892 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Serf1O88892 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Serf1O88892 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms