Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms