Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms