Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms