Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma3O70435 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma3O70435 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma3O70435 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma3O70435 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma3O70435 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma3O70435 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma3O70435 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma3O70435 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms