Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxq1O70220 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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