Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChkbO55229 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ChkbO55229 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ChkbO55229 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChkbO55229 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ChkbO55229 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms