Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ldb2O55203 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ldb2O55203 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ldb2O55203 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ldb2O55203 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ldb2O55203 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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