Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms