Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms