Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf13O54965 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rnf13O54965 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rnf13O54965 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rnf13O54965 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rnf13O54965 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rnf13O54965 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rnf13O54965 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf13O54965 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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