Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccr6O54689 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms