Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab33bO35963 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rab33bO35963 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rab33bO35963 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab33bO35963 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab33bO35963 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab33bO35963 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab33bO35963 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab33bO35963 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab33bO35963 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab33bO35963 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab33bO35963 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab33bO35963 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab33bO35963 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab33bO35963 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab33bO35963 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab33bO35963 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab33bO35963 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab33bO35963 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms