Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FxnO35943 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FxnO35943 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FxnO35943 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FxnO35943 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FxnO35943 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FxnO35943 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FxnO35943 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FxnO35943 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FxnO35943 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FxnO35943 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FxnO35943 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FxnO35943 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FxnO35943 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FxnO35943 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FxnO35943 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FxnO35943 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FxnO35943 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FxnO35943 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FxnO35943 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FxnO35943 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FxnO35943 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FxnO35943 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FxnO35943 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FxnO35943 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FxnO35943 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FxnO35943 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FxnO35943 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FxnO35943 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FxnO35943 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FxnO35943 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FxnO35943 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FxnO35943 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FxnO35943 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FxnO35943 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FxnO35943 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FxnO35943 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FxnO35943 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FxnO35943 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FxnO35943 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FxnO35943 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FxnO35943 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FxnO35943 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FxnO35943 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FxnO35943 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FxnO35943 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FxnO35943 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FxnO35943 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FxnO35943 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FxnO35943 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FxnO35943 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FxnO35943 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FxnO35943 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FxnO35943 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FxnO35943 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FxnO35943 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FxnO35943 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FxnO35943 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FxnO35943 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FxnO35943 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms