Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnd2O35927 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms