Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms