Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stag2O35638 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stag2O35638 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag2O35638 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag2O35638 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag2O35638 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms