Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a6O35544 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc1a6O35544 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a6O35544 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a6O35544 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a6O35544 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a6O35544 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a6O35544 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a6O35544 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a6O35544 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a6O35544 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a6O35544 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a6O35544 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc1a6O35544 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a6O35544 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms