Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Atf6bO35451 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Atf6bO35451 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Atf6bO35451 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Atf6bO35451 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Atf6bO35451 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Atf6bO35451 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Atf6bO35451 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Atf6bO35451 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Atf6bO35451 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Atf6bO35451 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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