Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Dgcr6O35347 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Dgcr6O35347 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Dgcr6O35347 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Dgcr6O35347 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Dgcr6O35347 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Dgcr6O35347 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Dgcr6O35347 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Dgcr6O35347 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Dgcr6O35347 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dgcr6O35347 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms