Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps1O08983 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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