Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms