Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna5O08543 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna5O08543 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna5O08543 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efna5O08543 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Efna5O08543 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna5O08543 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna5O08543 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna5O08543 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna5O08543 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna5O08543 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms