Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20939L7N243 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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