Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm379J3QQ19 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm379J3QQ19 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm379J3QQ19 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm379J3QQ19 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm379J3QQ19 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm379J3QQ19 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm379J3QQ19 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm379J3QQ19 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm379J3QQ19 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm379J3QQ19 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm379J3QQ19 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm379J3QQ19 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm379J3QQ19 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm379J3QQ19 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm379J3QQ19 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm379J3QQ19 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm379J3QQ19 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm379J3QQ19 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm379J3QQ19 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm379J3QQ19 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm379J3QQ19 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm379J3QQ19 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm379J3QQ19 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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