Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms