Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm20918J3QN17 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm20918J3QN17 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm20918J3QN17 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm20918J3QN17 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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