Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E030018B13RikJ3QMS9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms