Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms