Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms