Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms