Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Usp9yF8VPU6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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