Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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