Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5407E9Q7Q1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms