Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtproE9Q612 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtproE9Q612 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms