Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
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ApobE9Q414 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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