Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Hectd4E9Q2E4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms