Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
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Ccdc171E9Q1U1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc171E9Q1U1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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