Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms