Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms