Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms