Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9630041A04RikD3Z3U4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms